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華大“超級生命計算機”來了
時間:2018-10-26來源:科技日報

“超級生命計算機”來了!10月25日,華大集團子公司華大智造發(fā)布了其自主研發(fā)的最新超高通量基因測序儀。

  6臺機器一年可完成10萬人基因組測序

  國家級人群基因組學研究以及對遺傳資源的保護與應用是精準醫(yī)學的基礎,直接影響到一個國家在生物醫(yī)藥領域的核心競爭力。自國際人類基因組計劃之后,各國紛紛推出國家級大規(guī)模人群基因組測序項目。

  由于受到設備數(shù)量、速度和成本等現(xiàn)實原因的制約,基因組的測序效率在前幾年推進并不順利。以英國為例,2012年12月,英國啟動10萬人基因組計劃,一直到2018年7月,花了5年半的時間才完成7萬多例全基因組測序。

  此次發(fā)布的最新超高通量基因測序儀“MGISEQ-T7”,很可能改變這一現(xiàn)狀。其一天就可以完成60例個人全基因組測序,6臺機器一年可完成10萬人基因組測序,是目前全球日生產(chǎn)能力最強的基因測序儀,因此被人稱為“超級生命計算機”。

  “完全突破大家對測序儀的想象?!比A大智造首席執(zhí)行官牟峰表示,超快速、超高通量的T7必將對目前測序產(chǎn)業(yè)的發(fā)展起到強有力的推動作用,同時也標志著基于基因檢測的精準醫(yī)學研究,全面進入大數(shù)據(jù)時代成為可能。

  提速提速再提速

  據(jù)介紹,目前,市場上所有的測序儀最多只能支持兩張芯片同時運行,而T7的4聯(lián)芯片平臺采用獨特的芯片搭載技術,可實現(xiàn)4張芯片進行完全獨立的測序流程,如同4臺測序儀同時進行工作,且芯片間互不影響。

  不僅如此,T7可同時支持全基因組測序、超深度外顯子測序、表觀基因組測序、腫瘤大Panel基因檢測。也就是說,用戶可以按照他們的不同需求隨時隨地進行同時測序,并可以最大程度地節(jié)省時間。

  測序儀運行速度的快慢將直接影響到測序項目的交付時間,因此,業(yè)界始終致力于提升測序儀的運行速度。通過全面升級生化系統(tǒng)、光學系統(tǒng),并將圖像數(shù)據(jù)處理速度提升15倍,從而使得T7測序速度比行業(yè)最高水平還提升50%以上,僅需不到24小時便可完成PE150。

  T7將原有的芯片密度提高了20%,使得單張芯片即可實現(xiàn)Tb級數(shù)據(jù)產(chǎn)出。加之4張芯片可同時獨立運行,24小時無休輪轉,MGISEQ-T7每天最多可產(chǎn)出6Tb數(shù)據(jù)。此外,針對基因測序特殊的要求,華大智造研發(fā)出自動化樣本制備系統(tǒng)MGISP-960,單次最多可自動完成96個樣本的制備,完美支撐了T7測序通量需求,使其強大性能得以更充分體現(xiàn)。

  生命經(jīng)濟已然成為全球經(jīng)濟增長的新引擎,基因測序技術是生命經(jīng)濟的核心。此前,華大自主研發(fā)的國產(chǎn)化基因測序儀,打破了國外公司對基因檢測市場的壟斷,助力中國基因產(chǎn)業(yè)高端測序技術的源頭創(chuàng)新和上下游的協(xié)同發(fā)展。T7的發(fā)布,進一步鞏固了華大智造作為全球領先的基因測序設備生產(chǎn)制造商的地位,并使得華大集團成為全球唯一一個有能力構建一條從硬件制造到基因測序服務,再到大數(shù)據(jù)研究的完整基因測序產(chǎn)業(yè)鏈的機構。(作者:劉傳書)